Još je teško cjelovito sagledati ulogu Patriotske lige u pripremama za odbranu Bosne i Hercegovine, jer njezini čelni ljudi - Alija Izetbegović, Rusmir Mahmutčehajić i Hasan Čengić još nisu rekli ni mali dio onog što znaju, a pod embargom su i mnogi dokumenti PL. Međutim, poznato je da je PL formirala Stranka demokratske akcije, da su na čelu političkog, dakle, glavnog dijela, stajali Izetbegović, Mahmutčehajić i Čengić, koji su vojnom dijelu PL postavljali zadatke, odnosno naređivali šta da urade. Zna se da su čelni ljudi vojnog krila PL bili Meho Karišik Kemo, Sefer Halilović Halil, Sulejman Vranj Sule, Atif Šaronjić Emir, Munib Bisić Brko, Mustafa Hajrulahović Talijan, pa savjetnici Rifat Bilajac Čiča i Zićro Suljević Stari i mnogi drugi.
Uglavnom su to bili ljudi koji su vojno ustrojavali Patriotsku ligu i pripremali je za odbranu zemlje. Postojala su dva koncepta stvaranja budeće bosanske armije. Prvi je onaj Sefera Halilovića (formiranje regionalnih i opštinskih Štabova, manevarskih i prostornih jedinica -brigada i odreda, inžinjerijskih, sanitetskih i drugih jedinica). Drugi koncept je predlagao Atif Saronjić - Emir. On se zalagao da jezgro jedinica PL budu male diverzantske grupe, naoružane i uvježbane, oko kojih bi se kasnije stvarale jedinice. Njih dvojica dugo su vodili žučne polemike oko toga. Na kraju, usvojen je koncept Sefera Halilovića, ali je u taj koncept ukomponovan i Saronjićev koncept
Značajan događaj u ustrojavanju PL bilo je savjetovanje u Mehoriću 7. i 8. februara 1992., na kojem su, pored članova Glavnog štaba, učestvovali i komandanti regionalnih štabova PL. Tu je definitivno dogovorena Šema odbrane Bosne i Hercegovine, a na osnovu tog savjetovanja 25. februara '92. u Hrasnici je, opet u kući Kasima i Hasije Ibrahimović, Glavni štab PL donio "Direktivu za odbranu suvereniteta BiH". A ovo savjetovanje u Mehoriću značajno je i po tome što je na njemu Hasan Čengić, istupajući u ime političkog krila PL, dao smjernice kakva treba da bude bosanska armija, ako bude rata. Ukratko, te smjernice su bile ove: bosanska armija mora da ratuje viteški, ("Pucaj samo u onog, ko puca u tebe'*), mora da ima human odnos prema ratnim zarobljenicima, da ih ne smije ubijati i maltretirati, mora zaštititi civile, ne smije rušiti vjerske objekte i objekte kulture, u nju treba uključiti sve patriote, bez obzira na vjeru i naciju.
A evo kako je Glavni štab PL, na osnovu Direktive od 25. februara '92, planirao odbranu suvereniteta Bosne i Hercegovine. Prvo su navedene "snage dezintegracije" koje su već "stvorile uslove za potpunu dezintegraciju bosanskohercegovačke vlasti i cijepanje teritorije BiH". A u "snage dezintegracije", odnosno neprijateljske snage, ubrojani su "SDS sa Jugoslovenskom armijom i ekstremno krilo HDZ". Procjena neprijateljskih snaga je bila da JNA u BiH ima pet korpusa kopnene vojske i jedan ojačani VAK, snage SDS su procijenjene između 80.000 i 120.000 ljudi, a ekstremne snage HDZ jačine jedne do dvije brigade.
"Osnovni cilj djejstva ovih snaga", piše u Direktivi, "je podjela teritorije BiH i priključivanje matičnim (nacionalnim) državama". A ovaj cilj nastojaće da ostvare u dvije etape: "U prvoj etapi stvaranje nacionalnih konfederalnih jedinica u BiH, a u drugoj etapi priključenje istih Velikoj Srbiji i Velikoj Hrvatskoj".
U Direktivi' se iznosi podatak da Patriotska liga raspolaže "formacijama od voda do odreda i brigade, ukupne jačine 120.000 ljudi". Ali, sa otpočinjanjem borbenih djejstava, kaže se u Direktivi, "očekivati je veći priliv dobrovoljaca, pripadnika MUP-a BiH, pripadnika JNA, kao i snaga muslimanskog naroda van teritorije BiH. Time bi naše snage narasle na 150.000 ljudi".
Krupnim slovima je naveden osnovni zadatak snaga PL. A on je: "Zaštita muslimanskog naroda, očuvanje integriteta i cjelovitosti BiH, kako bi se obezbijedio i ubuduće zajednički život svih naroda i narodnosti na državnoj teritoriji BiH".
Ovom direktivom odbrana suvereniteta BiH, odnosno oslobađanje zemlje, planirano je u tri faze. Prva faza bi trajala 7, druga 15, a treća, završna, 45 dana. Dakle, po Direktivi PL, Bosna je trebala da bude oslobođena za 67 dana!
Kako?
Prvo, sa otpočinjanjem ratnih djejstava trebalo je "izvršiti zaštitu stanovništva i istovremeno zatvaranje glavnih pravaca... uz masovnu primjenu rušenja, zaprečavanja". Zatim, "unutar Republike određenim snagama brzim i energičnim djejstvima blokirati i zauzeti vojne objekte (skladišta naoružanja, municije i MES i kasarni), a potom, što prije, naoružati formirane jedinice," i nastaviti planirana djejstva. To bi sve trebalo uraditi u prvoj fazi. Dakle, za sedam dana.
U drugoj fazi planirano je zaustavljanje neprijateljskih snaga i stvaranje uslova "za spajanje snaga PL po više regija", odnosno povezivanje širih slobodnih teritorija i obezbjeđenje funkcionisanja lokalnih organa vlasti.
U trećoj etapi predviđeno je razvijanje širokih ofanzivnih djejstava "sa ciljem razbijanja, uništenja i protjerivanja neprijatelja sa teritorije BiH".
Komandno mjesto Glavnog Štaba PL planirano je "u rejonu Sarajeva".
